Como consigo configurar os valores de pagamento em duas formas?
Exemplo:
Pagamento a vista ou Pix com 5% de desconto, parcelado até3x sem juros sem os 5% de desconto.
Consigo fazer isso aqui na Loja Integrada???
Boa tarde @Click_mais tudo bem com você? 
Espero que sim.
Vi aqui que você já configurou a forma de pagamento via boleto bancário junto ao Mercado Pago com 5% de desconto.
Esse desconto não é aplicado para as formas de pagamento parcelado, sua configuração já esta em 3x sem juros.
Referente ao Pix, através dos dois meios de pagamentos ativos na sua loja (Mercado Pago e Pagseguro), você consegue disponibilizar ativar o checkout PRO (aquele onde o comprador é redirecionado ao ambiente deles para finalizar o pagamento). Mas dessa maneira, ainda não está disponível a possibilidade de oferece desconto via Pix.
O que mais tem agradado os lojistas é o PIX através do boleto da PagHiper: quando o lojista gera o boleto, já aparece o QR Code para realizar o PIX, e você conseguirá oferecer desconto. Dê uma olhada no passo a passo: Como configurar o Boleto e o Pix na PagHiper? | Ajuda Loja Integrada
Olá, tudo bem?
Essas infos ainda estão atuais?
Para oferecer desconto via PIX por enquanto somente usando o Pag Hiper?
Eu consigo usar pagtos do Mercado Pago + PagHiper na minha loja?
Obrigado