Oiii, @Lescoltonstore
Vi aqui que a opção de serviço de parcelamento externo não está habilitada, e ao utilizar o checkout transparente e essa opção está desativada, pode ocorrer do valor do pedido no painel ser diferente do cobrado pelo Mercado Pago.
Acontece que, o cálculo de juros que fazemos na plataforma é diferente do cálculo feito pelo MP. E quando o valor é cobrado, o valor considerado é o do meio de pagamento. A recomendação é que o lojista marque esta opção no painel. Isso resolve a questão da divergência entre valor cobrado pelo MP e o valor exibido no checkout.