Talyta não tem nada de errado ai, toda vez que você gera uma etiqueta nos correios ou melhor envio que seja você informa as dimensões e peso, na hora que você posta nos correios eles conferem a dimensão e peso informado, se for a mais eles cobram a diferença e se for a menos devolvem a diferença paga a mais. O problema no seu caso está no peso, apesar da dimensão informada também estar errada para mudar o preço devido ao tamanho da caixa tem que ser uma diferença bem grande, agora o peso nos correios varia de:
0 -> 500g
500g -> 1kg
1kg -> 2kg
2kg -> 3kg
E por ai vai de kg em kg, no seu caso você informou um peso menor que 500g logo caiu na primeira faixa de preço, mas quando conferiram o peso nos correios deu mais de 500g e caiu para a segunda faixa de preço te cobrando a diferença. Lembre-se que no cadastro do seu produto você deve ter colocado apenas o peso do mesmo, ai na hora que colocou produto+caixa+insumos de embalagem passou dos 500g gerando a diferença.
Abraços